Мыс Столбчатый сложен наслоениями базальтовых лав вулкана Менделеева с хорошо выраженной столбчатой отдельностью в виде 5-ти и 6-ти гранных колонн. В результате волновой эрозии массив вулканических пород постепенно разрушается, в результате чего мыс представляет собой живописные отвесные скалы высотой до 40-50 м.

Озеро находится на территории кратера взрыва. На его дне сформировалось месторождение серы. Название «кипящее» озеро получило благодаря тому, что его вода подогревается вулканическими газами. Иногда происходят залповые выбросы кипящей воды, а из-под земли начинают бить струи сернистого и сероводородного газов, вместе с горячими потоками воды.

Средняя температура воды здесь +34-36 градусов, но, несмотря на это, на северном берегу находятся кипящие грязевые котлы, температура которых достигает +80-100 градусов. Сера соединяется с металлами, поэтому на поверхности воды плавает серная пена. На берегу лежит изжелта-черный песок.

 Горячие источники сосредоточились на склонах и у подножия ещё одного памятника природы - действующего Вулкана Менделеева (887 м.). Его можно посетить, побывав в южной части о. Кунашир. Вулкан находится на 10-12 км. южнее п. Южно-Курильск, совсем недалеко от Южно-Курильского аэропорта, который стоит практически на вулкане.

Вулкан образован множественными слоями, застывшей лавы. Вязкая и густая, она застывает, не успев распространится на большие расстояния. Жерло вулкана окружено обширной кальдерой, образовавшейся при оседанием извергающихся масс.